Участник ЕГЭ, не согласный с результатами, может подать апелляцию. Она бывает двух видов — о нарушении порядка проведения ЕГЭ и о несогласии с результатами ЕГЭ в целом.
В первом случае выпускник, не выходя из Пункта проведения экзаменов, получает от организатора в аудитории два экземпляра формы для составления апелляции, заполняет их и передает уполномоченному представителю ГЭК, который удостоверяет их своей подписью. Один экземпляр передается участнику ЕГЭ, другой — в конфликтную комиссию. Ответ дается не позднее трех календарных дней. Если апелляция удовлетворена, результат ЕГЭ аннулируется, и выпускник сдает экзамен в резервный день.
Апелляция о несогласии с результатами ЕГЭ подается в течение двух рабочих дней после ознакомления с ними. После этого конфликтная комиссия назначает время и место ее рассмотрения.
